LINE-1（L1）反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子是腫瘤細(xì)胞中插入突變的來源。然而，腫瘤發(fā)生過程中L1轉(zhuǎn)移的臨床意義仍不清楚。文獻(xiàn)中作者從五種卵巢癌細(xì)胞系和HeLa細(xì)胞分離的多個(gè)單細(xì)胞克隆，采用逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子捕獲測序（RC-seq），在體外檢測到內(nèi)源性L1逆轉(zhuǎn)移。然后，作者在19例患者的卵巢腫瘤和匹配的血液樣本中采用RC-seq，確定了88個(gè)腫瘤特異性L1插入。在一種腫瘤中，內(nèi)含子中L1重新插入為普遍認(rèn)可的化學(xué)抗性基因STC1提供了新的順式增強(qiáng)子。值得注意的是，攜帶STC1 L1突變的腫瘤亞克隆化療后患病率增加，進(jìn)一步增加STC1表達(dá)。作者還鑒定了低甲基化的供體L1s，是腫瘤細(xì)胞和培養(yǎng)的癌細(xì)胞中新L1插入的原因。這些體外和體內(nèi)結(jié)果的一致性強(qiáng)調(diào)L1插入突變是卵巢腫瘤發(fā)生和癌癥基因組異質(zhì)性的常見組成部分。

參考文獻(xiàn)：
Nguyen THM, Carreira PE, Sanchez-Luque FJL, et al. Retrotransposon Heterogeneity in Ovarian Tumor Cell Evolution.Cell Rep.2018 Jun 26.

歡迎與我們的生物信息工程師交流，我們將免費(fèi)為您設(shè)計(jì)文章思路方案。